Universidad de Carabobo

Facultad de Ciencias de la Salud

Dirección de Investigación y Producción Intelectual

Software para aplicación Científica

(Hemos eliminado los enlaces, debido a la continua actualización de la información en Internet, se agradece buscar el programa de su preferencia mediante un buscador. Ej. Google, Yahoo entre otros)

BIBLIOEXPRESS

Base de datos especializada para bibliografía científica. Este programa permite almacenar y rescatar la información de sus artículos científicos, fotocopias, separatas, dar formato de la revista a donde se envía el artículo para publicar, etc. Estos programas constituyen la mano derecha del investigador a la hora de escribir los artículos

IMAGE ANALYZER

Procesador de imágenes científicas escrito para el NIH. Es capaz de capturar, mostrar, analizar, mejorar, medir, modificar y cambiar formatos de imágenes digitales a color y escala de grises. Incluye promediación, densimetría digital, sumas sucesivas de imágenes

WINDIG25

Programa para digitalizar datos desde imágenes. Carga imágenes bitmap de curvas o líneas y genera los valores numéricos.

COSINORWIN

Programa matemático para el cálculo de la dependencia con el tiempo de cualquier variable biológica o no. El método cosinor es el estándar para este tipo de análisis en cronobiología, cronofarmacología, cronofisiología, ritmos circadianos, etc.

ED50PLUS V1.0

Hoja de cálculo en excel para estudios de Dosis -Respuesta, permite calcular ED50, IC50, LD50, PD50, etc, graficar múltiples curvas, ajustar, interpolar, etc. Producido por el Dr. Mario Vargas del Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias de México.

KLUSTAWIN 3.3

Programa para análisis por componente principal y clusters 3D, permite clasificar de forma no supervisada data continua multidimensional (hasta 100K y 48 dimensiones). Desarrollado por W.J. Heitler de la Universidad St Andrew, Escocia.

CN3D

Programa de visualización tridimensional de estructura, secuencia y alineamiento de moléculas de proteínas, con capacidad de animación, zoom, rotación, localización de residuos, así como varias formas de representación molecular. Utiliza la base de datos de proteínas del NCBI del NIH-USA.

METAANALISIS.ZIP

Paquete de hojas en Excel para realizar metaanálisis: RRR, RRA, NNT, Odds ratio, sesgo, gráficos, etc. Sólo requiere introducir los valores en las tablas prediseñadas. Posee modelos, hojas explicativas y ejemplos. Desarrollados por el Grupo de Estudio, Docencia e investigación Clínica de la República Argentina (GEDIC).

IMAGE TOOL

Excelente procesador de imágenes ofrecido gratis por la Universidad de Texas (San Antonio) con capacidad para: densitometría, conteo de objetos, medidas de longitud, ángulos, áreas, perfiles, perímetros, filtros, brillo, contraste, rutina de calibración, cromatografías, electroforesis, radiología, calidad de publicación, Lee 22 formatos diferentes de imágenes. Integra hoja de cálculo estadístico.

IRIS V4.15A

Software de captura y procesamiento de imágenes a bajo costo (permite el uso de cámaras web). Diseñado para imágenes astronómicas pero con aplicación en imagenología biológica dada su capacidad de capturar tomas de larga duración y de sumar imágenes múltiples de corta duración (potencial uso en microscopía de fluorescencia o imágenes con leve intensidad de luz). Posee filtros digitales, supresión de ruido, técnicas de mask, conversión de formatos, grabación en formatos avi, bmp. Extracción de imágenes bmp a partir de avi. Procesamiento tricolor, fotometría, entre muchas otras capacidades.

PIC-VIEWER V2.3

Paquete de procesamiento de imágenes de fluorescencia de la Universidad Strathclyde (Escocia), permite adquirir y analizar imágenes de fluorescencia de cámaras confocales o normales. Lee y escribe formatos PIC, MetaMorph STK y TIFF. Convierte formatos 8 y 16 bit, analiza y grafica cambios de intensidad en serie Z, ajusta de curvas de intensidad, detección de objetos basada en umbral, creación de proyecciones, mezcla escalas de grises con imágenes RGB.

AVIEDIT

Editor de formato AVI, permite capturar, editar, modificar, filtrar imágenes de cualquier fuente (cámaras de video, webcam, scanner, memory sticks, etc.), convierte MPEG en AVI, extrae imágenes solas seriadas a partir de AVIs

CDC EZ - TEXT

Download: http://www.cdc.gov/hiv/software/ez-text.htm Desarrollado para el CDC de Atlanta para crear, manejar y analizar bases de datos cualitativas semiestructuradas obtenidas de cuestionarios realizados cara a cara o a partir de notas del entrevistador. Posee extensa capacidad de manejo de códigos y modificaciones. Diseñado para investigación cualitativa.

POP TOOLS

Colección de add-in para Excel que realizan análisis de modelos de matrices poblacionales, simulaciones de procesos estocásticos, análisis de modelos ecológicos, estudios de dinámica poblacional, modelaje económico y financiero, estadística de remuestreo, corridas de simulaciones Monte Carlo, tests de randomización, Mantel test, minimización y estimado de parámetros, entre otros. Software: Add-in para Excel (97,2K, XP), completo, gratis, manual, soporte, tutoriales y archivos de prueba. Requerimientos: Pentium, Win 9X, 2K, XP, Excel.

PDRAW32

Software para analizar ADN, clones, genes, hasta 3 fragmentos simultaneos, edición de secuencias, selección de enzimas de restricción, geles virtuales de agarosa, gráficos genéticos circulares, plots XY de homología, cálculo de termociclado PCR.

HISTOSTRETCHGRAYS

Programa para el análisis y mejoramiento del contraste de imágenes en tonos de grises y color, calcula la estadística de pixels: max, min, modo, mediana, media, desviación estándar, kurtosis. Ajuste automático del histograma de grises, conversión de color. Formatos: bmp, jpg, ico, emf y wmf. Software: completo, gratis con manual y documentación online. Requerimientos: Pentium, Windows 95, 98, 2000, XP(?).

VISUAL ANALYSER 5.6

Osciloscopio digital doble canal con trigger, analizador espectral, generador de ondas, frecuencímetro en dominio de tiempo y frecuencia. Cursores digitales con medición directa en pantalla. Utiliza la entrada de micrófono de la tarjeta de sonido del computador como entrada de señales (estéreo o monoaural, <5Voltios). Escrito por Alfredo Accattatis de Roma, Italia. Software: completo, 603 Kb formato zip, gratis, escasa documentación (intuitivo). Requerimientos: Pentium, Windows 95, 98, NT, 2000, XP.

ENGAUGE DIGITIZER

Software para obtener los valores numéricos correspondientes a la curva de un gráfico presente en una imagen o mapa. Los valores pueden ser copiados en otros programas de análisis o graficación (Excel, statistics, spss, etc). Puede ser usado en imágenes de EKG, EEG, EMG, curvas de publicaciones, etc., obtenidas con scanner, cámaras o copias de pantalla. Permite remover las lineas de fondo, trazar curvas, manejar gráficos cartesianos, polares, lin y log. Formatos: bmp, gif, jpg, png, pnm, xpm. Es desarrollado por Sourceforge. Software: completo, gratis con manual y documentación online. Requerimientos: Pentium, Win 95, 98, NT, ME, 2000, XP(?).

WIN EPISCOPE

Programa epidemiológico de la Wagenigen Agricultural University (Holanda) y la Universidad de Edinburgo, orientado a la epidemiología cuantitativa. Adecuado para diseño y análisis epidemiológicos. Pruebas Diagnósticas:Concordancia, Evaluación Avanzada de Pruebas Diagnósticos, Valor Umbral de una Prueba Diagnóstica, Pruebas Múltiples, Tamaño de muestras, análisis de medias, Detección de Enfermedad en una Población, Rechazo de Lotes, Estudios Caso-Control, Cohorte, Transversales, Modelos Modelo Reed-Frost: simulación de una epidemia. Software: Programado en Borland Delphi, completo, gratis con manual. Requerimientos: Pentium, Win 3.1, 95, 98, NT, ME, 2000, XP(?).

FREESTATISTICS

Colección de mas de 40 paquetes de análisis estadístico, cálculo y graficación. Software: Programado en varios lenguajes. Requerimientos: Pentium, Win 3.1, 95, 98, NT, ME, 2000, XP.

MWTWIN

Calculador de pesos moleculares, diluciones, fórmulas, notación de aminoácidos, modelado de fragmentación de secuencias peptídicas, cromatografía líquida capilar, distribución isotópica. Escrito por M. Monroe del Grupo de Química Analítica Jorgenson, de la Universidad de North Carolina. Software: Completo, documentado, Requerimientos: Pentium, Win 9X, NT, ME, 2000, XP.

KMSURV

Programa para el análisis univariado de datos de sobrevida y estimado no paramétrico para observaciones incompletas (Kaplan-Meier). Basado en la publicación original J Amer Stat Assoc 53: 457-481, 1958. Programado por Campos-Filho N, Franco E.L y Antonio Prudente A, de la Unidad de Epidemiología y Bioestadística del Instituto Ludwig de Investigación en Cáncer, Sao Paulo - Brazil Software: Programado para DOS, Completo, documentado con Manual. Requerimientos: 48X, Pentium, Win 9X, NT, ME, 2000, XP.

MISCELLANEOUS STUFF

Programa para el diagnóstico de errores innatos del metabolismo del recién nacido, posee acceso rápido a criterios diagnósticos, sintomatología y resultados de laboratorio. Permite el entrenamiento diagnóstico de manera interactiva al introducir datos laboratoriales y clínicos. Posee enlaces de Internet con bases de datos y fuentes adicionales de información. Creado por C K Lai. Software: Excel 95/5.0 or Excel 97, Completo, gratis. Requerimientos: 48X, Pentium, Win 9X, NT, ME, 2000, XP.

BUGS/PKBUGS (WINBUGS)

Bayesian inference Using Gibbs Sampling, software para análisis bayesiano de modelos estadisticos complejos usando métodos de Cadenas Markovianas Monte Carlo (MCMC). PKBUGS corresponde al módulo de cálculo para farmacocinética / farmacodinamia (PK/PD). Generado en la Unidad de Bioestadística, Imperial College School of Medicine (Londres) y la Universidad de Helsinki, Finlandia. Software: Completo, bien documentado, club de usuarios, gratis Requerimientos: 48X, Pentium, Win 9X, NT, ME, 2000, XP.

OPENSTAT4

Paquete estadístico que incluye: hoja de cálculo, estadística descriptiva completa, x-y plots, correlaciones pearson product-moment, correlaciones parciales, ANOVA 1-3 vías, ANOVA multivariado, ANOVA diseño mezclado, Latin Square ANOVA, Covarianza. Análisis multivariado: jerárquico, de factor y canónico y mínimos cuadrados, análisis no paramétrico, programas de medidas, financieros, simulaciones, redes neurales y matrices. Software: Programado en C++ Open source, gratis, ebook, Manual. Requerimientos: Pentium, Win 9X, NT, ME, 2000, XP.

TABLE ANALYSER

Hoja de cálculo para investigaciones en medicina basada en evidencia (MBE). Parámetros: CER, ARR, NNT, EER, RRR, sensibilidad, especificidad, LR+, LR-, prevalencia, RR, OR, NNH, Chi cuadrado, estudio de cohorte, caso control, tamaño de muestra. Generado en Centro de MBE de la Universidad de Oxford. Software: Programado en ambiente shockwave plug in, gratis, documentado. Requerimientos: Pentium, Win 9X, NT, ME, 2000, XP, Mac, Shockwave.

CLUSTER 3.0

Programa de código abierto para análisis de agrupaciones (Clustering) con aplicación en data de expresión genética. Incluye rutinas para agrupación jerárquica (pairwise simple, completa, promedio y vinculo centroide) clustering, k-means y k-medianas, mapas 2D auto-organizados, análisis de componente principal, ajuste y filtrado de datos. Software: gratis, completo, documentado. Requerimientos: Pentium, Win 9X, NT, ME, 2000, XP.

FILZIP

Programa de compresión y descompresión de datos en mas de 25 formatos, intercambia formatos, encripta, multiextrae, codifica, visualiza sin descomprimir. Extrema utilidad para manejo de grandes archivos de data experimental. Software: Escrito en Delphi, gratis, completo, documentado. Requerimientos: Pentium, Win 9X, NT, ME, 2000, XP.

PIXEL PROFILE

Este programa presenta las coordenadas RGB, o las coordenadas de intensidad de grises, saturación, en lineas trazadas sobre una imagen cualquiera. Software: Escrito en Delphi, gratis, completo, documentado. Requerimientos: Pentium, Win 9X, NT, XP(?).

STATPAGES.NET

Listado de hojas de cálculo estadístico en excel que incluyen métodos convencionales, medicina basada en evidencia, regresiones, correlaciones, comparaciones, significación, etc. Software: Escrito en excel y VB, gratis, completo, documentado.
Requerimientos: Pentium, Win 9X, NT, XP(?), excel.

ARLEQUIN

Paquete para el estudio de la genética poblacional ypolimorfismo genético, capaz de manejar grandes muestras de datos moleculares (RFLP, secuencias DNA, microsatélites), datos multi-locus y frecuencias de alelos. Escrito por Schneider et al., Universidad de Ginebra. Software: Gratis, completo, documentado con manual. Requerimientos: Pentium, MS-Windows (95/NT/3.1x) XP(?).

TRANSANA

Permite transcribir y analizar grandes colecciones de datos en video, identifica porciones clave del video, clasificación de clips, posee herramientas de búsqueda, colaboración multiusuario a tiempo real, análisis de comportamiento animal o humano, lenguaje gestual, prácticas docentes, estudios sociales. Puede usar múltiples cámaras. Usa formatos QuickTime, MPEG. Generado por la Universidad de Wisconsin (Madison), la National Science Foundation y el Centro de Supercomputación de San Diego (USA).Software: Gratis, completo, documentado con manual, soporte. Requerimientos: Pentium, Windows (95/NT/3.1x) XP(?), Mac.

DEMETRA 2.0

Paquete de análisis de series de tiempo, ajustes estacionales tipo X-12 ARIMA y Tramo/Seats, aplicable a grandes data. Trabaja con formatos FAME, MS-EXCEL, ASCII, SAS y ORACLE EXPRESS Software: Gratis, completo, documentado con manual, soporte.Requerimientos: Pentium, Windows (95/98/NT/XP).

SCHOLAR'S AID 4 LITE

Programa de manejo de literatura y referencias científicas y/o humanísticas, permite ordenar las separatas o fotocopias y recuperarlas rápidamente, formato a las selecciones de la base de datos según APA, ACS, MLA y otros. Inserta las citas seleccionadas directamente en el manuscrito. Software: Gratis, completo, documentado con manual, soporte. Requerimientos: Pentium, Windows (95/98/NT/XP).

PC OSCILLOSCOPE

PC Oscilloscope. Uno de los mejores osciloscopios digitales disponibles gratis en internet, usa la tarjeta de sonido del computador como puerto de entrada de las señales las cuales deben ser de bajo Voltaje (depende de la tarjeta de sonido). La velocidad de muestreo depende de la tarjeta de sonido (48KHz a 120KHz a 16 Bits de resolución), posee capacidad para dos canales, amplificación, barrido, X-Y, trigger de alto desempeño, frecuencímetro (FFT), generador de señales, cursores digitales V/T. Desarrollado por C. Zeitnitz de la Universidad de Mainz, Alemania. Software: Gratis, completo, documentado con manual. Requerimientos: Pentium, solo para Windows NT ó XP.

PROTEIN EXPLORER

Programa para la visualización y análisis de proteínas, gráficos 3D, rotación, amplificación, comparador de moléculas, alineación, hidrofobicidad, animaciones, usa el buscador de Internet como herramienta y las bases de datos internacionales.Software: Gratis, completo, documentado con tutoriales. Requerimientos: Chime plugin (gratis), Pentium, Windows 9X, 2k, NT ó XP, Mac.

IMAGE J

Procesador de imágenes, 8-16-32 bit, grises y color, formatos: TIFF, GIF, JPEG, BMP, ASCII, DICOM, FITS, PNG y PGM. Procesa 40 millones píxeles por segundo. Zoom, scroll. Crea áreas de interés de cualquier forma. Filtrado y análisis distancias, ángulos, áreas, densidades e histogramas, secuenciado de imágenes. Ideal para imágenes de fluorescencia y microscopia. Ofrecido por la División de Servicios a la Investigación de los Institutos Nacionales de Salud Mental y de Desórdenes Neurológicos de los Estados Unidos de Norteamérica.

MEDAL ALGORÍTMOS MÉDICOS

Recopilación en línea de cálculos, fórmulas, tablas, criterios, imágenes y sonidos de uso en ciencias de la salud. Contiene más de 7000 algoritmos, organizados en 45 capítulos, disponibles como hojas de cálculo. Desarrollado por el Institute for Algorithmic Medicine, USA. Dispone de versión en castellano.

AUDACITY

Programa de grabación y edición de audio usado en música, puede servir de plataforma para señales electrofisiológicas (corriente AC < 4 Voltios, Ej.salida de los amplificadores (EEG, ECG, EMG, señales neuronales y afines), se conecta la señal a la entrada del micrófono ó line in de la tarjeta de sonido del computador. El programa graba (2 canales) a 96 KHz de velocidad de muestreo (depende de la tarjeta de sonido), mezcla señales, procesa archivos de gran tamaño, indica los niveles de señales, edita, realiza análisis espectral, filtra ruido, ecualiza, importa y exporta formatos diferentes: WAV, AIFF, AU, MPEG, CD en 16, 24 ó 32-bit.

VIRTUALDUB

Utilidad rápida y de pequeño tamaño (850 Kb) para captura y procesamiento de videos, capaz de procesar, editar, limpiar y filtrar gran cantidad de videoscon formato AVI, lee imágenes MPEG-1 y BMP. De gran utilidad para preparación rápida de videos de experimentos y/o clases prácticas.

SIMG

Software de captura, control y procesamiento de imágenes originalmente diseñado para astronomía pero de gran valor en imagenología biológica y medica. Soporta cámaras firewire, larga exposición, control tiempo real de cámaras, multiformato, generación de falsos colores, patrones bayer de color, exposiciones mulitiempo, lectura de ruido, filtros (Wiener, van Cittert's, Richardson Lucy), procesamiento avanzado de imágenes. Generado por S. Ziegenbalg (Alemania).

WINGENE

Análisis de secuencia de nucleótidos: complemento reverso de secuencia, traslado de secuencias en varios formatos, exporta polipéptidos codificados, análisis de oligomeros y de restricción. Generado en el Dpto.de Genética de desarrollo de plantas del Instituto de biología de plantas, Universidad de Zurich.

 

WINPEP

Análisis de secuencias de aminoácidos, longitud, composición, punto isoeléctrico, absorción molar, simulaciones, modificaciones postranslacionales, ruedas helicoidales, gráficos hidropáticos, estructura de dominios.

REGISTAX V3

Programa de procesamiento avanzado de imágenes/video, resolución nativa 1024x768 y máximo 4000x4000 pixels, acceso directo al disco duro, 10.000 imágenes en secuencia de video. Formatos: Múltiple AVI (>2Gb), PNG, AVI, BMP/JPEG, TIFF, FIT. Filtrado, sustracción de ruido y se matriz de pixeles calientes, promedios y alineado de imágenes múltiples de baja luminosidad, análisis y procesamiento por ondículas, además de las funciones clásicas de procesamiento. Inicialmente dirigido a imágenes astronómicas pero de gran utilidad en imágenes biomédicas.

SOUND
ANALYSIS PRO (SA+)

Sistema integrado de estudio de la vocalización animal. Entrenamiento operante, reproductor multicanal, grabador inteligente, herramientas de análisis automático de sonido, base de datos exportable a excel/Matlab, reconocimiento, vocalización, segmentación, espectro, video, modelaje vocal, sintaxis, análisis tiempo real, clasificación automática, reconocimiento de patrones, cambios vocales, etc.

PSYCH/LAB

Conjunto de programas para efectuar pruebas de psicología cognitiva humana y experimental. Aporta los valores procesados y crudos exportables. Incluye: Donders Reaction Time, FLEX1, Inhibition of Return of attention, Lexical Decision. Memory Scanning. Mental Rotation. Muller-Lyer Illusion. Precuing Visual Attention. Signal Detection. Stroop Interference. Autor: RA Abrams, Psicología Experimental, Universidad de Washington, USA.

INSTACAD

Paquete para diseño asistido por computadora (CAD) con capacidad de modelado rápido y sencillo de sólidos y visualización 3D, vectoriales, escalas, rendering y múltiples proyecciones. De utilidad en reconstrucciones 3D de cortes histológicos, anatómicos, moleculares, instrumentación. Autor: Vincent Yu

PUBCRAWLER

Sistema de alerta para publicaciones, explora diariamente en Medline, PubMed, NCBI y GenBank, notificando los resultados selectos (por usuario) al email. Autor: Ken Wolfe, Genetics Department, Trinity College Dublin, Irlanda.

LORETA

Dado el hecho que el EEG/MEG no contiene suficiente información para determinar la distribución de la actividad neuronal en el volumen cerebral, LORETA constituye una aproximación para su cálculo mediante el uso de tomografía electromagnética cerebral de baja resolución como solución lineal, distribuida y 3D al problema EEG/MEG inverso. Autor: R.D. Pascual-Marqui, Brain-Mind Research, University Hospital of Psychiatry, Zurich, Suiza.

GENOMIC LAB

Serie muy completa de programas de análisis en genómica y biología molecular: Análisis de imágenes de microarreglos, análisis de clusters y visualización, fuzzy k-means clustering, Tree / Maple View, datos de expresión combinada y análisis de secuencias. Autor: M Eisen et al., Lawrence Berkeley National Lab (LBNL), Dept. Genome Sciences, University of California, Berkeley.

HRV

Software de análisis de la variabilidad del RR a partir de data del electrocardiograma. Calcula estadística general, segmental, regresión lineal, Media NN, dNN (MSD), Mediana, 95% 99% CI, lnHRV, Coef. Variación, Varianza, SDNN, SENN, SDSD, RMSSD, NN50, pNN50, SDANN, SDNN, SDASD, t-test intersegmentos, Modus, F(X), Skeweness, Kurtosis, Índice de Variabidad, Análisis espectral. Múltiples formatos de data. Autor: Nevrokard.

SEA

Sound Emission Analyzer. Paquete de análisis en tiempo real de señales bioacústicas, permite la caracterización espectrográfica de señales adquiridas vía tarjeta de sonido de un PC a 48kHz. Autor: Pavan G. Centro Interdisciplinario de Bioacústica e Investigación Ambiental, Universidad de Pavia, Italia. Software: Gratis, documentado. Requiere que el usuario se registre para descargarlo.

TEXTSTAT

Programa de análisis de textos capaz de leer formatos en ASCII, .TXT, HTML, Word, Open Office, etc. permite análisis de concordancia, frecuencias de palabras y verbos, etc. Autor: Dutch Linguistics, Free University of Berlin.

PEAKMASTER 5.1

Programa para el análisis de electroforesis de zona capilar con predicción de electrolitos de fondo y análisis de picos, BGE y eigenmobilities. Autor: Grupo de procesos de separación por electromigración, Universidad Karlova, Praga, República Checa.

ASSEMBLING STEREO ANAGLYPH IMAGES WITH PHOTOSHOP

Artículo publicado en Modern Microscopy que describe una metodología sencilla para la generación de imágenes tridimensionales en microscopia (luz o electrónica) mediante la técnica de imágenes estéreo pares coloreados. Autor: J Russ, Dpto. Ciencias de los Materiales, North Carolina State University, Raleigh, USA. J Russ, Reindeer Graphics, Inc., Asheville, USA.

SCANNER RECORDER

Programa que realiza grabaciones de cualquier señal entrante por la tarjeta de sonido del computador activándose o deteniéndose de acuerdo a un umbral preestablecido, ahorrando espacio en el disco duro. Visualiza la onda, graba y reproduce en formato .wav. Autor: D Jacobs.

PRIMOPDF

Convertidor de archivos a formato PDF, encriptado 40 - 128 bit de gran seguridad, permite password, características definibles de impresión total o parcial del documento, información resumen, e-book. Usa formatos Word, Excel, Powerpoint o cualquier otro formato de impresión.

FREECAD

Paquete de diseño 2D/3D, con capacidad panorámica, movimiento e interacción de piezas, coordenadas espaciales, cálculo de alto desempeño. Software: Libre, código abierto, completo, totalmente gratis, documentado.

CCLEANER

Freeware, limpiador rápido de archivos temporales, huérfanos, flotantes, lo que permite correr más rápido el computador y desinstalar programas no necesarios, desocupando espacio en el disco duro. Software: Completo, totalmente gratis, documentado. Requerimientos: Windows 9X, 2K, NT, XP.

G3DATA

Programa que permite extraer los datos numéricos a partir de un gráfico (escaneado). Las publicaciones contienen gráficos, sin embargo, sus datos no siempre están disponibles, g3data ayuda en la obtención de la data. Autor: Jonas Frantz Software: Libre, GNU, completo, totalmente gratis, documentado. Reque-rimientos: Windows 9X, 2K, NT, XP.

EEGLAB

Software de registro, análisis y visualización de señales EEG, Potenciales asociados a eventos, u otras bioseñales. Permite análisis de componente independiente, análisis de frecuencias, mapping cerebral, voltaje/tiempo. Autor: Computational Neurobiology Laboratory at The Salk Institute y Swartz Center for Computational Neuroscience (SCCN). Software Libre, GNU, completo, totalmente gratis, documentado. Requerimientos: Windows 9X, 2K, NT, XP, Linux, o Mac OS. Matlab 5 o superior.

GIMP

Software libre para el procesamiento de imágenes y animaciones,  edición, filtrado, multiples formatos, retoque, omposición, capas vectoriales, código abierto, multiplataforma. Software: Libre, GNU, completo, totalmente gratis, bien documentado. Requerimientos: Windows 9X, 2K, NT, XP, Linux, o Mac OS.

OPENOFFICE

Aplicación de software libre equivalente al Office. Multiplatforma , multilingue , de código abierto. Compatible con archivos de Office, está formado por las aplicaciones: Calc , Draw , Math , Impress y Writer . Software: Libre, GNU, completo, totalmente gratis, bien documentado. Requerimientos: Windows, Mac OS XX11, GNU/ Linux , Solaris ).

SCRIBUS

Publisher en software libre de calidad profesional, vistas previas separadas, scripting multiplataforma, PDF avanzado (creación y lectura), color CMYK, separaciones, color ICC, salida en PDF/X-3, EPS, Unicode text , vectoriales, SVG, OpenType Fonts , XML, mas de 25 idiomas, canal IRC y listas de correos. Software: Libre, GNU, completo, totalmente gratis, bien documentado. Requerimientos: Windows, Mac OS, GNU/ Linux , Solaris

FREE MAC / WINDOWS EMULATORS DOWNLOADS

Varios emuladores que permiten correr software de Mac en Windows o vice versa. Software: Libre, GNU, completo, totalmente gratis, bien documentado. Requerimientos: Windows / Mac.

PRAAT

Programa de análisis: fonético, habla, intensidad, formato, pausas, cocleograma , patrones de excitación, espectrograma, series de tiempo, series de eventos, alfabeto fonético, articulación, identificación, segmentación. Usa archivos de hasta 2 gigabytes (3 horas), gráficos de alta calidad. Autores :  P Boersma y D Weenink , Institute of Phonetic Sciences , University of Amsterdam , Holanda . Software: Libre, GNU, completo, totalmente gratis, bien documentado. Requerimientos: Windows, Mac , Linux , Solaris

SPL ANATOMY BROWSER

El laboratorio de planificación quirúrgica de la Universidad de Harvard ofrece en línea un explorador anatómico con imágenes interactivas 2D y 3D. Autores : C Umans , M Halle , P Golland , R Kikinis . Harvard Medical School , Brigham and Women's Hospital, MIT. Software: En línea, completo, applet , totalmente gratis, bien documentado. Requerimientos: Windows, Mac , Linux , Solaris , acceso a internet

DWGGATEWAY Y DWGVIEWER

Paquetes gratuitos para abrir y editar imágenes y archivos de cualquier versión de AutoCAD , para reconstrucciones 2D y 3D. Autores: SolidWorks , inc. Software: GNU, completo, totalmente gratis, documentado. Requerimientos: SoftwareWindows, hardware Pentium IV.

REACTOME

Proyecto colaborativo entre  el Cold Spring Harbor Laboratory, European Bioinformatics Institute, y el  Gene Ontology Consortium para desarrollar una base de datos sobre vías y reacciones biológicas humanas, actualizada y cruzada con las bases de datos de NCBI, Ensembl, UniProt, UCSC Genome Browser , KEGG, ChEBI, PubMed y GO. Contiene además datos de 22 especies animales, plantas y bacterias. Autores:  Gene Ontology Consortium. Software Completo, totalmente gratis, código abierto, libre, documentado. Requerimientos: Windows, Mac, Linux, Solaris.

LIVE COUNTER CLASSIC

Contador de visitas para páginas web, permite conteos de ingresos, timbre a tiempo real, conteo oculto, conteo múltiple, identificación de visitante, estadísticas. Software: Completo, gratis si no tiene fines comerciales, documentado. Requerimientos: Windows, Mac, Linux, Solaris.

DYNAMICS SOLVER

Resuelve numérica y gráficamente sistemas dinámicos continuos o discontinuos. Ecuaciones diferenciales de cualquier orden, mapas iterativos y recurrentes de dimensión arbitraria. Ilustración matemática, fractales, diagrama de fases, Poincaré, Liapunov, histogramas, bifurcación, atractores, entre otras funciones. Autor: Aguirregabiria J. Software: Completo, gratis, documentado. Requerimientos: Windows, Mac, Linux, Solaris.

BACKGROUND SUBTRACTION TOOLKIT

Produce iluminación de fondo uniforme en fotografías digitales con variación de iluminación o con gradientes de iluminación en el campo visual. Autor: Parry-Hill M y Davidson M, National High Magnetic Field Laboratory, Florida State University, USASoftware: Desarrollado en Java, Completo, gratis, documentado. Requerimientos: Multiplataforma.

SPEEDTEST

Portal que permite medir la velocidad de la conexión de internet con precisión, tanto para download como para upload. Autor: Speedtest.com. Website:  Software: corre en línea, gratis, documentado. Requerimientos: Windows, Mac, Linux, Solaris.

DICOMWORKS

Visualizador de imágenes médicas (TAC, RM, Rx) en formato DICOM de alta resolución, convertidor multiformato, editor de imágenes, cinemática. Autor: Ph Puech y L Boussel, Lyon, Francia. Software: Completo, gratis, documentado. Requerimientos: Buena tarjeta gráfica con memoria suficiente.

CURTIPOT ACID-BASE PH AND TITRATION 3.2.3

Calculador/simulador de titulación ácido-álcali, base de datos pKa (250 soluciones), generador de diagrama de distribución, equilibrio iónico, estequiometría, modelos poliproticos (40 especies), potenciometría, búffers. Autor: Ivano G.R. Gutz. Software: Completo, gratis, documentado. Requerimientos: Windows98,Me,2K,XP. Requiere Excel

NLYZER

Paquete de análisis de datos con métodos de dinámica lineal y no lineal, secuencial o en paralelo. Incluye predicción no lineal, cálculo de parámetros no lineales, teoría de información, análisis de dependencia multidimensional, entropía condicional, dimensión fractal , FFT, correlación, filtrado. Autor: J Holzfuss , Institute of Applied Physics , TU Darmstadt , Alemania. Software: Completo, gratis, documentado. Requerimientos: Windows 95/98/NT/2000/XP.

SIMPLEDICOM RECEIVER & VIEWER

Visor y manejador de imágenes y data DICOM (CR, CT, MR, DS, etc.), exporta en formato jpg o TIFF. Autor: University of Pittsburgh Medical Center. Software: Completo, gratis, documentado. Requerimientos: P III-IV, 128MB RAM, Windows 95/98/NT/2000/XP, Internet Explorer / Netscape.

FASTPCR

Diseño de primers para PCR, PCR inverso, secuenciado de aminoácidos, sílico PCR, PCR de grupo específico, detección automática de loci SSR, Secuenciado y alineación, clustering, secuenciado repetido, análisis de enzimas de restricción, elementos MITE, búsqueda de Loci SSR. Autor: R Kalendar, University of Helsinki. Software: Completo, gratis, documentado. Requerimientos:128MB RAM, Windows 95/98/NT/2000/XP.

IFRIT   IONIZATION FRONT INTERACTIVE TOOL

Paquete de visualización para cualquier data 3D, extremadamente potente y relativamente fácil de usar. Código abierto, Software libre. Autor: Nick Gnedin. Software: Completo, gratis, documentado, con soporte. Requerimientos: Windows 95/98/NT/2000/XP, Linux, Mac

PSYCH / LAB

Paquete de programas de psicología experimental, análisis experimentales, tiempo de reacción Donders , FLEX1, Inhibición del retorno de atención, decisión léxica, anáñisis de estímulos, exploración de la memoria, rotación mental, ilusiones Stroop . Interference. Autor : Richard A. Abrams , Psychology Department, Washington University.

VB WEB CAM

Software de captura de imágenes desde cámaras webcam (cámaras de chat - Internet) inicialmente diseñado para astrofotografía pero con aplicación directa en biomedicina a muy bajo costo (solo requiere el software y la cámara web, usa el sistema parafocal). Permite un control completo de las variables de exposición, graba imágenes fijas, video y audio, exposición de larga duración, sustrae píxeles calientes. Uso en fotografía digital con el microscopio o cualquier equipo óptico. La larga exposición es aplicable en microscopia de fluorescencia. Autor: Thomas Kraus, Alemania. Software: Completo, gratis, documentado, en inglés, soporte. Requerimientos: Windows 95/98/NT/2000/XP.

DATAVIEW

Paquete de visualización y análisis de datos electrofisiológicos digitalizados, reconocimiento y análisis de eventos, clasificación de espigas (componente principal 3D), filtrado, transformación, ondeletas, ajuste de curvas, sonogramas, FFT, conversión de formatos, lee señales grabadas en formato .txt. Autor: W. Heitler, University of St Andrews, Scotland, UK. Software: Completo, gratis, documentado, con soporte. Requerimientos: Windows 95/98/NT/2000/XP. Usando DataView, otros programas y un computador convencional es posible armar un sistema de registro y análisis electrofisiológico a muy bajo costo, en detalle: Señal - Amplificador (señal menor a 4 voltios) - Tarjeta de sonido del
computador (line in o micrófono, muestreo 48kHz) - Programa de grabación de música o sonido (CoolEdit, Audition, WaveEdit, etc.) - Grabar señal en formato .txt - DataView (Lectura, clasificación, visualización y análisis). Este sistema no requiere prácticamente inversión comparado con sistemas comerciales cuyo costo es de aprox. Bs. 45.000.000,oo
Sugerencia del sistema de registro: A Eblen-Zajjur, Universidad de Carabobo.

VSPECT

Análisis espectral de imágenes en formato .pic  y  .tif. Es un programa inicialmente pensado para astronomía pero con aplicación en biomedicina. Permite obtener perfiles espectrales, calibración de longitudes de ondas, filtrado, extracción, cuantificación, sustracción, comparación de perfiles espectrales, identificación de elementos químicos, librería espectral, exportación a excel. Autor: V Desnoux, Paris, Francia. Software: Completo, gratis, documentado, con soporte. Requerimientos: Windows 95/98/NT/2000/XP.

TINYQUANT

Utilidad para análisis densitométrico de bandas en geles , escalas de grises de 16 bit (formato .TIFF o . gel ) o color RGB de 24 bit (.TIFF). Permite conversiones de formatos, perfiles de densidad, ajuste gamma. Autor: N. Iscove , Division of Stem Cell and Developmental Biology , Ontario Cancer Institute , Canada. Software: Completo, gratis, documentado, con soporte. Requerimientos: Windows 98/NT/2000/XP.

NEUROSCOPE Y KLUSTERS

Dos programas para visualización de registros neurofisiológicos unitarios, multiunitarios, de campo, EEG, EMG (Neuroscope) o para la clasificación manual o automática de espigas por el método del componente principal (Klusters). Autor: Laboratorio Buzsáki, Rutgers University, Newark Campus Center for Mol & Beh Neuroscience, Newark, USA. Software: Completo, gratis, documentado, con soporte. Requerimientos: Linux, Windows 2000/XP.

INSTAT+

Paquete estadístico rápido, sencillo pero potente, ideal para cálculos rápidos y/o para docencia media/avanzada de la estadística. Autor: Centro de Servicios Estadísticos de la Universidad Reading , Reino Unido. Software: Completo, gratis, documentado, con soporte. Requerimientos: Windows.

GP TEMP4

Software que al combinarse con resistencias (de bajo costo) y/o termistors permite monitorizar, grabar, graficar y procesar hasta cuatro puntos simultáneos de temperatura usando el puerto de juegos del computador como vía de captura de la señal. Muy útil y tremendamente económico si se requiere registrar temperaturas de forma automática y simultanea (4 puntos). Ejemplos: Baños de María, reacciones químicas, cultivos celulares, gradientes térmicos corporales/objetos/fluidos. Autor:  J Fager. Software: Completo, gratis, documentado, con soporte. Requerimientos: Windows 9X, XP.

AGENDA / PROGRAMADOR

Agenda, bloc de notas, tarjetero, planificador, recordatorio, gestor de avisos, contabilidad, teléfono y llamadas automáticas, calculadora, impresión de datos, exporta data. Autor: Multisoft. Software: Completo, gratis, documentado, con soporte. Requerimientos: Windows 9X, 2K, NT, Me, XP.

BBHELP

Recopilación de ayudas para biología molecular, protocolos, guías, procedimientos , recipes , buffers , códigos genéticos, enzimas de restricción . Autor: B Babb. Software: Completo, gratis, corre en linea . Requerimientos: Multiplataforma.

G-PRIME

Sugerido por el Dr. Jesús González Vega - UCV.
Paquete para realizar registro y análisis de eventos múltiples en fisiología. Osciloscopio digital, registro y grabación continua de datos, detección y análisis de potenciales de acción, marcaje de eventos, análisis a tiempo real y fuera de línea. Usa la mayoría de las tarjetas A/D incluyendo la tarjeta de sonido del computador, como ingreso de la señal al computador. Autor: G K Lott III. Universidad de Cornell , USA. Software: Completo, gratis, muy documentado. Requerimientos: Windows 9X, 2K, XP.

ROTANDSTACK

Software de captura y procesamiento de imágenes de cámaras digitales (incluyendo webcams) que permite grabar múltiples escenas de baja luminosidad para luego superponer digitalmente las imágenes y mejorar las áreas de interés (fluorescencia, microscopia, etc.). Remueve los píxeles anómalos de la cámara (sustracción de foto negra). Corrige rotación de cada imagen debido al movimiento del objeto de interés. Usa formato .jpg Autor:  G Dargaud, Paris, Francia. Software: Completo, gratis, documentado. Requerimientos: Windows 9X, 2K, XP.

SURGE

Programa para generar mapas de interpolación (Mapping) por el método ABOS, lee datos de coordenadas x,y,z en formato .txt, calcula volúmenes, importa data en formatos DEM, GRASS, ArcGIS y Shapefile, escalas de colores editable. Muy útil para generar mapas con pseudo colores de la actividad eléctrica biomédica (ECG, EEG), ecología, epidemiología, geografía, entre otras aplicaciones. Autor: M Dressler, República Checa. Software: Gratis, documentado. Requerimientos: Windows 9X, 2K, XP.

CURTIPOT

Programa de cálculo, análisis y simulación de pH , titulación ácido-base, diagramas de distribución, base de datos pKa , soluciones acuosas sencillas o de hasta 30 especies en equilibrio, pH vs volumen, método de regresión para el mejor ajuste. Autor: I G Rolf , Instituto de Química, Universidade de São Paulo, Brasil. Software: Macro de Excel, no requiere instalación, gratis, documentado. Requerimientos: Windows 9X, 2K, XP, Vista, Excel.

STEREOPHOTO MAKER (SPM)

Programa para editar y ver imágenes en formato estereopar. Muy útil para foto micrografía y fotografía biomédica 3D. La visualización no requiere equipo adicional al computador (Método de ojos cruzados o paralelos) y permite añadir tridimensionalidad a las fotos de cortes histológicos. El portal ofrece además decenas de vínculos de interés. Autor: M SUTO, Japón. Software: Completo, gratis, documentado, permite trabajar en línea. Requerimientos: Windows 9X, 2K, XP, Vista o Mac.

CSDIFF

Herramienta de comparación de archivos y carpetas, detecta las diferencias entre ellas por línea, palabra o letra, y las edita. Analiza archivos .doc , . zip y carpetas completas. Ideal para correcciones de tesis, manuscritos, listados, códigos fuente, códigos de máquina, etc. Autor: componentsoftware. Software: Gratis. Requerimientos: Windows 9X, 2K, XP, Vista.

WINIDAMS

Paquete estadístico presentado por la UNESCO, posee modernas capacidades gráficas, manejo de datos, importa y exporta en varios formatos, manejo de tablas, regresión, anova , análisis discriminante, clusters, componente principal, segmentación, codificación, tipología, entre otras muchas funciones. Autor :UNESCO. Software: Gratis, muy documentado. Requerimientos: Windows 9X, 2K, XP, Vista.

AXOCALC

Programa para cálculo de los parámetros de cable para fibras neuronales de sección cilíndrica. Calcula: resistencia específica de membrana, resistencia longitudinal, constante de espacio, capacitancia, constante de tiempo, resistencia de un cilindro infinito, resistencia de una esfera del mismo diámetro. Autor: Hartline D. Software: Gratis, código fuente BASIC, corre en cualquier BASIC, documentado. Requerimientos: QBASIC, GW-BASIC, QuickBASIC.

SPEECH FILING SYSTEM SFS

Sistema de análisis del habla con grabación, reproducción, marcado, reconocimiento, análisis espectral y de formato, cálculo de frecuencia fundamental, creación de rutinas propias. Autor: Dept of phonetics & linguistics, University College of London, UK. Software: Gratis, completo, muy documentado y con soporte. Requerimientos: Windows 9X,2K, NT, XP, Vista

VISTA

Paquete de análisis estadístico en formato visual, dinámico e interactivo, presentación de gráficos con calidad de publicación. Descriptiva, distribuciones, ANOVAS, regresión simple y múltiple, análisis log-lineal, componente principal, correspondencia, cluster. Autor: Forrest W. Young, L.L. Thurstone Psychometric Laboratory, Department of Psychology, University of North Carolina , USA . Software: Libre, código abierto disponible, gratis, completo, muy
documentado y con soporte. Requerimientos: Windows 9X,2K, NT, XP, Vista, Mac, Unix.

SCANALYZE

Analizador de imagines de microarreglos de AND, utilizando imágenes de uno o dos colores fluorescentes de hibridaciones generando una tabla de  resultados. Autor : M Eisen , Department of Molecular and Cellular Biology, Univerisity of California at Berkeley . Software: Gratis, completo, muy documentado y con soporte. Requerimientos: Windows 9X, 2K, NT, XP, Vista.

ZZ INTERACTIVE 2-DIMENSIONAL AND 3-DIMENSIONAL DATA MODELING

Portal para el cálculo en línea de curvas y superficies de ajuste 2D y 3D de calidad para publicación, histogramas y gráficos de errores, curvas, superficies, contornos, posee buscador de mejor ajuste. Corre en línea. Autor : James R. Phillips. Software: Multiplataforma. Requerimientos: Windows 9X, 2K, NT, XP, Vista.

BALLVIEW

Aplicación autosuficiente para visualización y modelaje molecular. Software libre, robusto, fácil de usar, constituye el estado del arte en visualización/modelado molecular. Software: Completo, documentado, libre. Requerimientos: Windows, Linux , MacOS.

CLAMWIN

(Sugerencia del Prof. S Buccella , FCS-UC). Antiviral de código libre con alto porcentaje de detección de virus y spyware , planificador de búsqueda de virus, actualizaciones automáticas de la base de datos de virus, buscador de virus en demanda, integración con los menús de contexto de Microsoft Windows Explorer, soporte de añadidura a Outlook. Software: Completo, documentado, libre, actualización automática. Requerimientos: Windows 9X, 2K, NT, XP, Vista.

ASSISTAT

ANOVA, Tukey Test, t Test, Duncan Test, Dunnet Test, Scott-Knott Test, SNK Test, regresión, correlación, test de coeficientes de correlacion, Cochran Test, Bartlett Test, Mann-Whitney Test, Kruskal-Wallis Test, Friedman Test, Kolmogorov-Smirnov, Shapiro-Wilk, Anderson-Darling, Cramer-von Mises, Kuiper, Lilliefors y Watson tests, test de ajuste. Análisis de componente principal, factoriales 2x2x2, regresión polinomial. Autor: F Assis, Unidad Académica, Ingeniería agricultural, Universidad Federal de Campina Grande, Brasil. Software: Completo, documentado. Requerimientos: Windows.

TNTLITE

Paquete de análisis geoespacial para levantamientos 2D/3D arqueológicos, biológicos, epidemiológicos y similares. Autor: MicroImages. Software: Completo, documentado con librerias y coordenadas. Requerimientos: Windows o Mac.

HEMODIFF

Programa que convierte la computadora y su teclado en un contador diferencial de células para hematología. Posee galería de imágenes controles y patológicas, reporte de resultados, cálculo porcentual, Autor: J Nickels, Dpto. Patología clínica, Universidad de Helsinki, Finlandia. Software: Completo, documentado con literatura. Requerimientos: Windows Win3.1/95/98/NT/W2000/XP, winzip o winrar.

 

BAL2000

Sistema experto para el análisis e interpretación de las muestras de lavado broncoalveolar. Utiliza el teclado del computador como contador diferencial de células. Presenta los resultados en forma gráfica y analítica con sugerencias diagnósticas. Este sistema tiene más de 6 años en uso en Finlandia. Software: Completo, documentado con literatura. Requerimientos: Windows Win3.1/95/98/NT/W2000/XP, winzip o winrar.

PIXAREA

Programa que calcula el área de interés de un corte histológico (tumoral o de cualquier naturaleza) en mm cuadrados y/o en % del corte. Utiliza imágenes escaneadas o fotomicrografias. El área de interés (ROI) es determinada por el usuario. Software: Completo, documentado con literatura. Requerimientos: Windows Win95/98/NT/W2000/XP, winzip o winrar.

RENAL

Rutina de cálculo nefrológico en la que se ingresan 12 parámetros sanguíneos y urinarios a partir de los cuales aporta los siguientes resultados: clearance de creatinina (medido, estandarizado y estimado), índice de insuficiencia renal, clearance de agua libre y excreción fraccional de sodio filtrado. Software: Completo , gratis. Requerimientos: Win3.1/95/98/NT/W2000/XP, vbrun300.dll, winzip o winrar.

GRID CELL COUNTER

Herramienta de ayuda para el conteo de células en imágenes digitales, superponiendo un retículo calibrado sobre la imagen, de cualquier formato digital. Software: Completo, gratis. Requerimientos: Win98/NT/W2000/XP y cualquier visor de imágenes.

MEDIAN FLUORESCENCE INTENSITY (MFI)

Programa para detector y analizar data de intensidad fluorescente media en citometría de flujo, detecta picos de fluorescencia y los cuantifica, convierte histogramas en archivos con formato .TXT y viceversa. Software: Completo, gratis. Requerimientos: Win98/NT/W2000/XP/Vista.

GOOGLE MAPS

Visualizador de mapas, carreteras, calles, imágenes satelitales. Útil para levantamientos epidemiológicos, salud pública, sectorización de campañas de vacunación, etc. Software: Corre en línea, portal de google, gratis. Requerimientos: Multiplataforma.

WAVOSAUR

Paquete de grabación de sonidos con aplicación directa en fisiología. Graba bioseñales directamente del bioamplificador usando las entradas de micrófono o line-in de la tarjeta de sonido del computador (señales <4 Volt), graba, reproduce, edita, visualiza la señal tipo osciloscopio a tiempo real, permite dos canales si se dispone de una tarjeta de sonio estéreo, analiza: potencia RMS, min & max, FFT, espectrograma 2D & 3D, sonograma, generador de ondas, calibración. Software: Completo, gratis, muy documentado, foro de usuarios. Requerimientos: Win98/NT/W2000/XP/Vista.

ONSCREEN DNA

Modelo virtual del ADN, nomenclatura, bases nitrogenadas, reconstrucción 3D, rotaciones, acoplamiento de bases, cinética, desnaturalización. Software: Completo, gratis, con tutoriales y ayudas. Requerimientos: Win XP o Vista, Mac OS 10.3.9.

ESBSTATS

Paquete estadístico con cálculo descriptivo, inferencia, hipótesis, macros, matemáticas, series de tiempo, probabilidad, regresión, graficación, importar / exportar data. Software: Completo, gratis, con tutoriales y ayudas. Requerimientos: Win 98, Me, NT, 2K, XP o Vista.